绝大部分木马、黑客程序、病毒来是随系统启动而运行的。因此，揪出系统启动过程中的隐患，可以有效保证电脑的安全。
一、Msconfig法
传统的Msconfig是我们找出启动隐患最方便的办法。在Windows 98/XP/2003中，我们可以直接打开。其方法是打开“运行”窗口，输入“msconfig”后回车即可打开该配置工具。
根据操作系统版本的不同，打开的窗口会有所不同。不过，其中最主要的就是“启动”选项卡，我们只需要切换到该标签，然后从中将下结来历不明的启动项取消，这样即可达到禁止其运行的目的。
如果是Windows 2000系统，虽然默认状态下没有提供msconfig，这也没关系。我们只需要到其它系统中复制msconfig.exe，然后将其保存到 Windows 2000系统之中。双击复制过来的文件，这时会提示找不到某些系统文件，对此可以直接跳过，直至进入配置窗口。
二、注册表法
注册表同样是我们揪出启动隐患的一个好地方。打开“运行”窗口，输入“regedit”并回车即可打开注册表编辑器。我们只需要依次打开 HKEY_CURRENT_USERSoftwareMicrosoftWindowsCurrentVersionRun和 HKEY_LOCAL_MACHINESOFTWAREMicrosoftWindowsCurrentVersionRun，其右侧的键值就是随系统启动时运行的程序。对于不必随系统启动或强行添加的程序就可以直接按下“DEL”键将其删除。
小提示：系统启动是自动运行的项目，而在任务栏的快速启动中则可以帮助用户快速打开相应的程序。
三、服务查看法
由于系统的各项服务都是在启动时启用的。因此一些病毒、木马会把自己注册为服务，以达到随系统启动的目的。
对此，我们同样可以在注册表中进行查看。打开注册表，找到 HKEY_LOCAL_MACHINESYSTEMCurrentControlSetServices，其下面的每一项都代表启动时自动运行的一项服务。在每一项下的start表示启动类型，如果值为2则表示随系统自动启动，3表示手工启动，4表示禁用，根据自己的实际需要决定这些服务是否继续在启动时被执行。
查看服务另外一个更简单的方法是在系统中直接打开服务管理器。进入“控制面板”，双击“管理工具”中的“服务”，这样我们就可以非常清楚的查看每个服务的状态和启动方式，同时还可以根据服务的介绍判断该服务是否为系统服务或正规服务。如果是非法服务，那么赶将将其禁用，并将其“启动类型”设为“已禁用 ”。
当然，找出系统启动隐患的方法还有很多，例如在启动时使用杀毒软件进行检查等。只要我们注意到系统的异常情况，及时查看任务管理中正在运行的进程，那么一定能够将这些隐患全部揪出来。